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中国热科院发布芒果精细基因组图谱 揭示芒果进化和驯化机制
作者:     发表时间:2020-10-27    [浏览量:2]
摘要:  我国热科院品资所联合中科院微生物所等10家单位,制作了芒果染色体等级精密基因组图谱,并从基因组水平上提醒了芒果物种进化机制和栽培种类驯化前史。相关研讨成果在......

  我国热科院品资所联合中科院微生物所等10家单位,制作了澳门凯时芒果染色体等级精密基因组图谱,并从基因组水平上提醒了芒果物种进化机制和栽培种类驯化前史。相关研讨成果在线宣布在基因组范畴国际尖端杂志《Genome Biology》(IF=14.028)上。
  芒果是漆树科芒果属热带常绿大乔木,是国际第五大果树作物,也是第二大热带果树作物。芒果种质资源丰富,但现代育种实践中对芒果资源的使用极为有限,长期以来,芒果育种首要依靠实生选种、杂交育种等方法,其育种周期长、约束要素较多。芒果基因组的解析,将为芒果种质资源研讨及其分子规划育种翻开全新窗口。我国热科院于2014年启动了芒果基因组解析研讨,经过多年的尽力,取得了重大突破。
  研讨团队经过对传统芒果种类阿方索进行深度测序和拼装,得到了巨细为393Mb的芒果精密基因组图谱。对拼装和注释成果进行剖析,成果标明,芒果祖先于3300万年前邻近发生了全基因组仿制事情,而仿制后的双复制基因中,与能量代谢相关的基因被选择性保留了下来,这些基因可能为该时期芒果应对大气二氧化碳浓度急剧下降和全球气候变冷供给了适应性优势。一起研讨团队在很多扩张的基因宗族中,发现一个名为CHS的宗族可能与漆酚组成相关。漆酚是芒果等漆树科物种中特有物质,该物质能引起人体激烈的致敏反响。该发现将为说明漆酚组成的分子机制供给根底。该项目还对48个芒果种类和4个同为芒果属的近缘物种进行了重测序。进一步剖析标明,芒果传统种类分为印度和东南亚两大类群,而大都商业种类呈现了等位基因稠浊。存在于我国南部和东南亚国家的芒果农家种类,在东南亚类群中形成了一起的亚类群;有意思的是,海南等部分区域的农家种资源也呈现了和商业种类相似的等位基因稠浊。
  该研讨首要得到了中央级公益性科研院所根本科研业务费和国家科技资源服务渠道项目的支撑。我国热科院品资所陈业渊研讨员、王鹏博士,中科院微生物所胡松年研讨员为该文章一起通讯作者,我国热科院品资所王鹏、黄建峰、以及中科院微生物所骆迎峰和高胜寒为一起榜首作者,来自11个单位的共29名科研人员参加了该研讨。
  论文全文网址:
  https://genomebiology.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s13059-020-01959-8 日期:2020-10-26  

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